Open Babel

Screenshot Software:
Open Babel
Mga detalye ng Software:
Bersyon: 2.3.2
I-upload ang petsa: 17 Feb 15
Nag-develop: Geoff Hutchison
Lisensya: Libre
Katanyagan: 58

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

Buksan ang Babel ay isang open source, collaborative, libre at multiplatform software library na dinisenyo upang kumilos bilang isang kemikal toolbox espesyal na ininhinyero upang makilala ang maraming wika ng kemikal data. Ito ay tinatawag lamang sa & ldquo; Ang Open Chemistry Toolkit & rdquo;. Tampok sa isang glanceWith Buksan ang Babel, ang mga gumagamit ay magagawang upang maghanap, pag-aralan, i-convert, at ang data na tindahan mula sa kimika, molecular modeling, byokimika, pati na rin ang iba pang kaugnay na mga lugar. Sinusuportahan nito ang isang malawak na hanay ng mga karaniwang mga format ng file kemikal, kabilang ang Mol2, SDF / Mol, PDB, XYZ, ngiti, at CML.
Bilang karagdagan, Buksan ang Babel ay nagbibigay ng suporta toolkit, kemikal MIME isang buong itinatampok na programmer, ang SMARTS matcher, atom kakayahang umangkop / typer ng bono, ang pagtanggal ng hydrogen at karagdagan, bitvector klase, matrix at vector pagbabago, pati na rin ang isang molecular pagsubok suite.Under ng hood at suportado operating systemsOpen Babel ay nakasulat nang buo sa C ++ programming language. It & rsquo; Sa totoo cross-platform software na sumusuporta sa GNU / Linux, BSD, Solaris, SGI, Microsoft Windows at mga operating system ng Mac OS X. Ang parehong 32-bit at 64-bit na mga computer ay opisyal na suportado sa oras ng pagsusulat ng this.Getting Magsimula sa Buksan BabelFirst ng lahat, masidhi ka naming inirerekumenda na i-install Buksan ang Babel pamamagitan ng paggamit ng pre-built na binary pakete mula sa mga repositoryo ng default na software ng iyong pamamahagi ng Linux. Kung ang iyong system GNU / Linux hindi pini kang Open Babel na software sa Repos nito, pagkatapos mo & rsquo; magkakaroon ka upang ipunin at pag-install ang application gamit ang unibersal na pinagmumulan I-archive na ibinigay sa Softoware.
I-download ang tarball (tar.gz archive), kunin ito sa isang lokasyon na gusto mo, magbukas ng terminal emulator, mag-navigate sa folder na kinuha at isagawa ang & ldquo;. Cmake & rdquo; utos (nang walang mga panipi) upang i-configure ang proyekto. Pagkatapos, dapat mong mapatakbo ang & ldquo; gawin & rdquo; utos, walang mga quote, siyempre, upang ipunin ito. Mangyaring tiyakin na ang CMake tool sa naka-install sa iyong operating system bago ang mga tagubilin sa itaas

Ano ang bagong sa paglabas:.

  • Ang release na ito ay kumakatawan sa isang pangunahing bug-fix sa press at dapat maging isang matatag na pag-upgrade, Lubos na inirerekomenda para sa lahat ng mga gumagamit ng Open Babel. Maraming mga bug at pagpapahusay ay naidagdag sa nakaraang taon mula noong 2.3.0 release.

Ano ang bagong sa bersyon 2.2.2:

  • Ang release na ito ay kumakatawan sa isang pangunahing bug-fix na paglabas at ay isang matatag na pag-upgrade, Lubos na inirerekomenda para sa lahat ng mga gumagamit ng Open Babel. Habang naroon ay maaaring hindi maraming bagong mga tampok, maraming mga pag-crash at iba pang mga bug na-fixed dahil 2.2.1.
  • Na-upgrade sa bagong InChI 1.02 release upang makabuo ng standardized InChI at InChIKey output.
  • Mga Fixed maraming mga error Estereokimika kapag nagbabasa / nagsusulat ng ngiti. Ito ay bahagi ng isang mas malaking proyekto na kung saan ay natapos sa 2.3 release.
  • Mga Fixed compilation at pag-install sa Cygwin at MinGW platform.
  • makabuluhang pinabuting aromaticity at Kekule pagtatalaga ng bono.
  • Pinahusay na 2D - & gt; 3D coordinate na henerasyon
  • Pinahusay na coordinate henerasyon gamit ang --gen3d operasyon command-line
  • Pinahusay na pagganap para sa coordinate na henerasyon.
  • Bagong --fillUC operasyon command-line para sa Babel.
  • Pag-aayos sa PH-umaasa hydrogen karagdagan.
  • Nagdagdag ng suporta para sa pagbabasa vibrational data mula sa Molden, Molpro, at NWChem output file.
  • Na-update atomic radii mula sa kamakailang mga maximum na mga kalkulasyon.
  • Mga Fixed bug kapag nagbabasa gzip-compress na Mol2 o XML file.
  • Isara ang mga file pagkatapos ng isang error. Inaayos ng isang bug sa Pybel kung saan ang mga file ay mananatiling bukas.
  • Maraming mga pag-aayos sa bug nang higit pa at maliliit na mga pagpapahusay sa tampok. == Bagong File Format ==-import at export:
  • Molpro input at output.
  • VASP coordinate file (CONTCAR at POSCAR).

Ano ang bagong sa bersyon 2.2.1:

  • Pinahusay na mga interface scripting, kabilang ang Python 3 suporta at pinahusay Java at C # suporta.
  • Nagdagdag ng suporta para sa MACCS fingerprint. Salamat sa proyekto RDKit.
  • Maraming mga pag-aayos at pagpapabuti sa lakas patlang ng code. Sa partikular, ang UFF puwersa patlang na pagpapatupad ay dapat na pangasiwaan ang marami pang mga molecule.
  • Pinahusay na 3D coordinate henerasyon, lalo na may singsing mga fragment. Maaari mong ibigay ito sa isang try sa obgen utility.
  • Ang Nakatakdang ng iba't-ibang PDB-import ang mga error sa mga uri ng atom.
  • Nagdagdag ng suporta para sa pagbabasa ng mga singil at radii mula sa mga format PQR file.
  • Nagdagdag ng suporta para sa pagbabasa at pagsusulat ng mga cell unit sa PDB format.
  • Bagong & quot; output & quot; format ng file para sa pagkuha ng generic na & quot; .out & quot ;, & quot; .log & quot ;, at & quot; .dat & quot; mga file at pagbabasa sa mga angkop na uri ng file batay sa mga nilalaman. Kasalukuyang gumagana lubos na rin para sa kabuuan kimika pakete.
  • Idinagdag pinabuting handling error at pag-uulat kapag nagawang i-load ang mga format ng file.
  • Pinahusay na suporta CIF format ng file.
  • Maraming, maraming, maraming karagdagang mga pag-aayos sa bug at pagpapahusay sa maliit.

Katulad na software

JChemPaint
JChemPaint

2 Jun 15

XDrawChem
XDrawChem

3 Jun 15

Viewmol
Viewmol

3 Jun 15

gElemental
gElemental

2 Jun 15

Iba pang mga software developer ng Geoff Hutchison

Avogadro2
Avogadro2

22 Nov 14

ChemSpotlight
ChemSpotlight

13 Dec 14

Mga komento sa Open Babel

Mga Komento hindi natagpuan
Magdagdag ng komento
I-sa mga imahe!