QuasiRecomb

QuasiRecomb ay isang magaang na application na tumatakbo sa utos console, simulating isang modelo Markov para sa pagbuo ng viral Quasispecies. Inilalarawan nito ang henerasyon ng mga viral quasispecies at isang paraan upang ipahiwatig ang mga parameter nito sa pamamagitan ng pagsusuri susunod na henerasyon ng data sequencing. Ang modelo ay napatunayan sa kunwa data, na nagpapakita ng kalamangan sa tahasang paglalaan ng proseso ng recombination sa account, at nasubok sa pamamagitan ng paglalapat upang bumabasa nakuha mula sa mga pang-eksperimentong HIV sampol. Nag-aalok ito ng pagpapatupad ng em algorithm upang mahanap ang maximum na nababatay sa pagsubok pagtatantya ng parameter ng modelo at isang paraan upang matantya ang pamamahagi ng mga viral strains sa quasispecies

Mga Kinakailangan :.

Java