Gabedit

Gabedit ay isang graphical User Interface sa Gaussian, Molcas, Molpro at computational kimika packages MPQC.
 
 Gabedit kabilang ang graphical na mga pasilidad para sa pagbuo ng mga keyword at mga pagpipilian, mga detalye Molekyul at doon seksyon input para sa kahit na ang pinaka-advanced na mga uri ng pagkalkula Gabedit kabilang ang isang advanced molecule Builder.
 
 Maaari mong gamitin ito upang mabilis na gumuhit ng plano sa mga molecule at suriin ang mga ito sa tatlong sukat. Maaari kang bumuo ng mga molecule ng atom, ring, group, amino acid at nucleoside. Maaari mo ring basahin geometry mula sa isang file. Karamihan sa mga malalaking mga format molecular file ay suportado.
 
 Gabedit kabilang ang isang window Pagkalkula Setup Gaussian, Molcas, Molpro at MPQC na nagpapahintulot sa iyo upang i-set up Gaussian, Molcas, Molpro at MPQC trabaho sa isang simple at matapat na paraan.
 
 Gabedit kabilang ang isang text editor para sa pag-edit ng Molcas, Molpro, Gaussian at MPQC input file.
 
 Gabedit maaaring graphically ipakita ang isang pagkakaiba-iba ng Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC at (bahagyang) pagkalkula ADF mga resulta, kabilang ang sumusunod:
 
 ย ท molecular orbitals.
 ย ท ibabaw mula sa mga elektron density, electrostatic potensyal, NMR shielding density, at iba pang mga katangian.
 ย ท ibabaw ay maaaring ipinapakita sa solid, translucent at wire mesh mode.
 ย ท ibabaw maaaring kulay sa pamamagitan ng isang hiwalay na ari-arian.
 ย ท Contours (colorcoded).
 ย ท Eroplano (colorcoded).
 ย ท Dipole
 ย ท XYZ axes at ang principal axes ng Molekyul.
 ย ท Animation ng normal na mode na naaayon sa vibrational frequency.
 ย ท Animation ng pag-ikot ng geometry, ibabaw, dipole, xyz at ang principal axes ng Molekyul.
 ย ท Animation ng contours.
 ย ท Animation ng colorcoded eroplano.
 
 Gabedit maaaring ipakita IR at Raman nakalkula spectra. Gabedit maaaring bumuo ng isang povray file para geometry (atom + bono, kabilang ang bond hydrogen ng), ibabaw (kabilang colorcoded ibabaw), contours, colorcoded eroplano.
 
 Gabedit maaaring i-save ang larawan sa PPM, BMP, (JPEG) at PS format. Gabedit maaaring makabuo awtomatikong isang serye ng mga larawan para sa animation (panginginig ng boses, geometry tagpo, pag-ikot, contours, colorcoded eroplano)

Ano ang bago sa release na ito:

• Minor bug ay naayos.
• NWChem ay suportado na ngayon.
• Ang mga katutubong laro Windows ay suportado na ngayon.

Ano ang bago sa bersyon 2.3.5.:

• Minor bugs ay nakatakda
• Atoms ay maaaring takdang panahon ng isang molecular dynamics simulation.
• Migration mula sa Cairo sa OpenGL para sa pagguhit ng window geometry.
• Migration mula gtkglarea sa GtkGLExt.
• parallelization gamit OpenMP.

Ano ang bago sa bersyon 2.3.0.:

• Minor bugs ay nakatakda
• Maaaring basahin ang orbitals, geometry at normal mode mula sa isang fchk Gaussian Ang file ng user.
• ay maaaring basahin ang One ang orbitals mula sa bagong format mopac aux file (kabilang ang mga compress na format).
• Maraming mga bagong opsyon sa XYPlot at ContoursPlot bintana (insert text, linya, arrow, mga imahe, mga bagong tema ...).
• Ang haba ng bono ay maaaring takdang panahon ng isang MD simulation.
• Bahagyang optimization ay posible na ngayon sa MM potensyal.
• Pagpapatupad ng isang kasangkapan upang mahulaan ang mga masa at abundances ng isotopes para sa isang naibigay Molekyul. Pagpapatupad ng isang kasangkapan upang kalkulahin ang electrophilic, nucleophilic at radikal susceptibilities para sa isang Molekyul.

Ano ang bago sa bersyon 2.2.0:

• Minor bugs ay nakatakda
• Lahat geometric na pagbabago maaaring bawiin at maulit gamit ang I-undo at redo (u / U o Ctrl z / Ctrl y)
• may Ang gumagamit ng kumpletong kontrol sa mga bono na ipinapakita sa isang drawing.
• Ang pagguhit ng Molekyul atom sa pamamagitan ng atom ay pinasimple.
• Ang pagguhit ng Molekyul fragment ng fragment ay pinasimple.
• Gabedit basahin connectivities mula gabedit, hin, pdb, mol2 at mol file.
• user ay maaaring itakda ang mga halaga ng distance, anggulo bono at dihedral anggulo.
• Ang isang molecular dynamics conformational search ay ipinatupad gamit ang isang MM potensyal (Amber 99).
• Ang isang molecular dynamics conformational search ay ipinatupad gamit ang isang Semi-mula sa obserbasyon paraan (mula sa Open Mopac o PCGamess).
• Migration mula GDK function drawing sa Cairo.: Cross-aparato-render para sa Vector Graphics
• Cairo ngayon ay ginagamit para sa mga XYplot gabedit widget (na ginagamit ng gabedit para gumuhit spectrums).
• Cairo ngayon ay ginagamit para sa mga geometry pagguhit window.
• ay maaaring nailipat na Geometry sa eps, PS, pdf o svg file.
• Ang alon ng XYplot window ay maaaring nailipat na sa eps, PS, pdf o svg file.
• Bagong kasangkapan para sa compute distansya sa pagitan ng 2 puntos sa XYPlot window. & Quot; button shift & quot Control +; ay maaaring gamitin para gawin ang isang zoom sa XYPlot window.
• Ang bagong bersyon ng PCGamess (alitaptap) ay suportado na ngayon

Ano ang bago sa bersyon 2.1.13:

• Minor bugs ay fixe
• Ang isang molecular dynamics conformational search ay ipinatupad gamit ang isang MM potensyal (Amber 99).
• Ang isang molecular dynamics conformational search ay ipinatupad gamit ang isang Semi-mula sa obserbasyon potensyal (gamit MOPAC o PCGAMESS).
• Ang isa ay maaaring ma-optimize ang geometry interactive gamit MOPAC o PCGamess semi-mula sa obserbasyon paraan, mula sa Draw Geometry window
• Migration mula GDK function drawing sa Cairo: Cross-aparato-render para sa Vector Graphics. Cairo ngayon ay ginagamit para sa mga XYplot gabedit widget (na ginagamit ng gabedit para gumuhit spectrums). Cairo ngayon ay ginagamit para sa mga geometry pagguhit window.
• ay maaaring nailipat na Geometry sa eps, PS, pdf o svg file. Maaaring nailipat Ang alon ng XYplot window sa eps, PS, pdf o svg file.
• Bagong kasangkapan para sa compute distansya sa pagitan ng 2 puntos sa XYPlot window. & Quot; Control + kaliwang pindutan ng & quot; ay maaaring gamitin para gawin ang isang zoom sa XYPlot window.
• Ang bagong bersyon ng PC Gamess / alitaptap ngayon ay suportado

Kinakailangan :

• gtk +