Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere nag-aalok ng natatanging kombinasyon ng panitikan-pagmimina at pagtatasa pathway para sa molecular biologist na interesado sa gene regulasyon at biological network.
 BiblioSphere pathway Edition ay gumagamit ng isang komprehensibong database ng mga kanya-kanyang modelo relasyon sa pagitan ng mga gene, protina, complexes, mga cell at tisiyu kasama ang up-to-date na mga diskarte sa teksto ng pagmimina para sa mga automated na kaalaman bunutan upang payagan mong i-link ang iyong data sa biological mga network sa iba't-ibang bayolohikal na konteksto.
 Gamitin BiblioSphere sa

• pahabain ang biological na mga network na lampas sa canonical na impormasyon pathway (regulatory & metabolic)
• pagsamahin ang iyong mga mataas na mga resulta ng throughput may biological na kaalaman at sequence batay pagsusuri
• magsagawa context- sensitive regulasyon pagtatasa ng pathway
• bumuo ng pathway na mga variant na tukoy sa eksperimento
• link daanan sa mga mekanismo at mga gene sakit
• gawin ang mga advanced na pang-eksperimentong disenyo

Ano ang bagong sa paglabas:

Bago at Pinahusay na Mga Pinagmulan ng Data

• Genomatix Expert na gawa Gene-Gene Ugnayan:
   Genomatix integrated na nito sa pagmamay-ari na kaalaman-base ng ekspertong na gawa ng data sa gene regulasyon sa BiblioSphere. Ang natatanging pinagmulan ng data ay nagdadagdag ng semantic ng relasyon gene gene-sa dynamic na nabuong BiblioSphere gene mga network, na nagbibigay ng impormasyon tulad ng "Gene Ang pagiging aktibo ng transcription ng gene B" o "Gene Isang pisikal na nakikipag-ugnayan sa gene B".
  
• Signal Transduction daanan:
   Ang mga bahagi ng Gene ontolohiya may-katuturan sa transduction signal pati na rin ang data pinagsama-sama mula sa panitikan na-pinagsama upang paganahin ang pagkakakilanlan ng canonical na daanan naka-link sa naka-focus sa network.
  
• Metabolic pathway Kaugnayan:
   Metabolic asosasyon pathway na-integrated upang payagan ang pagkakakilanlan ng metabolic kaganapan katuturan sa iyong hanay ng mga gene.
  

• pathway na may Tanawin ng ekspertong na gawa relasyon gene gene-
   Gene mga pangkat ay pinagsama-sama sa madaling maaaring maunawaan dynamic na mga graph network ng pagsasama-sama ng kamay na gawa gene gene-ugnayan sa data na nakuha mula sa mga automated na kaalaman bunutan. Mga Network ay maaaring ipasadya sa pamamagitan ng mga filter at nakatuon sa isang gene nakasentro na paraan upang magsagawa ng pinakamaikling landas pagtatasa.
  
• Cellular lokalisasyon Tingnan
   Batay sa mga gene GO Mga Anotasyon ay nakatalaga sa kanilang subcellular lokasyon at visualized bilang isang diagrammed layout ng cell, na nagbibigay-daan sa iyo upang tukuyin ang subcellular rehiyon at compartments may-katuturan sa iyong mga gene set.
  

• Pamamahala ng Proyekto: Pamahalaan ang iyong pagsusuri sa pamamagitan ng pag-aayos ng mga ito sa mga folder proyekto. Mabilis na ma-access ang nakaraang mga resulta sa loob ng ilang mga pag-click ng mouse o magdagdag ng mga bagong paghahanap sa mga umiiral na proyekto.
  

• iba't-ibang maliliit na pagpapahusay at bugfixes

Mga Kinakailangan :

• Mac OS X 10.2 o mas mataas
• Java 1.4.1 (-update 1 ay inirerekomenda)
• koneksyon sa internet
• ng Genomatix pagsusuri account (walang bayad)