CLC DNA Workbench

CLC DNA workbench ay lumilikha ng isang software na kapaligiran pagpapagana ng mga gumagamit upang gumawa ng isang malaking bilang ng mga advanced sequence DNA ay pinag-aaralan, pinagsama sa makinis na pamamahala ng data, at mahusay na graphical opsyon sa pagtingin at output.
CLC DNA workbench ay magagamit sa Windows, Mac OS X, at Linux platform

Features .

• Bioinformatics tampok sa Gene workbench :
• Flexible pagtingin ng circular molecule.
• Editor para graphically at algorithmically advanced panimulang aklat disenyo
• Assembly ng data sequence DNA
• Molecular cloning
• Awtomatikong SNP annotation ng sequences
• Hanapin at pagtuklas ng mga pattern ng DNA
• pinag-aaralan ng Local kumplikado rehiyon
• reverse pagsasalin mula sa mga protina na gene, batay sa mga talahanayan ng pagsasalin mula sa isang bilang ng mga species
• Advanced na pagtatasa at pamamahala pagrerenda enzyme
• Dot plot based na pinag-aaralan
• Short form statistics DNA kabilang ang isang bilang ng mga katangian ng isang naibigay na Molekyul
• search sequence data NCBI
• Access sa info ng web mula sa PubMed
• Iba pang mga tampok bioinformatics:
• DNA, RNA at editor sequence ng protina sa pagpapakita sa parehong haba at bilog molecule
• DNA, RNA, at alignment ng protina editor
• Interactive logos kasama ang parehong DNA, RNA at protina alignments
• Batch processing ng pinag-aaralan sa maramihang mga sequences sa isang work-step
• Paksa search
• Pattern discovery (hindi kilalang patterns)
• Advanced re-alignment at ayusin-point option alignment
• Sequence logo graphs kasama DNA, RNA, at protina alignments
• Manwal annotation ng sequences
• Integrated PubMed paghahanap
• sequence paghahanap sa Web-based na gamit BLAST
• Dot plot based na pinag-aaralan
• pinag-aaralan ng Local kumplikado rehiyon at pagiging kumplikado plots
• maliit na bahagi Gap graphs
• G / C nilalaman na pagtatasa at graphs
• Project at pamamahala data:
• Full integration ng input data, pamamahala ng data, ang mga resulta ng pagkalkula, at export ng data
• Detalyadong log history
• Lahat ng uri ng mga file ay maaaring nai-save sa mga lokal na proyekto, at inilunsad mula sa programa
• I-import at i-export ng data sa isang malaking bilang ng mga format ng file
• Pagpipilian ng mga nagtatrabaho sa ilang mga aktibong workspaces sa isang panahon,-enable ang magkakasabay na trabaho sa maramihang mga proyekto
• I-import ng mga bakas ng mga file ng data at mga marka ng kalidad mula sa automated DNA sequening machine gamit Standard chromatogram Format, ABI format at PHD format (Phred)
• Pagtingin at pag-uulat:
• Advanced BLAST view

Tingnan ang
• Advanced graphs
• Advanced histogram view
• Advanced dot plot view
• Maghanap para sa mga katangian sa sequences at alignments

Kinakailangan :

• 256 MB RAM na kinakailangan
• 512 MB RAM inirerekomenda
• 1024 x 768 inirerekomenda display

Limitasyon :

• 4-linggo fully functional na demo