FlexS

hinulaan FlexS ang tulad at oryentasyon ng isa sa mga ligands na may kaugnayan sa iba pang isa. Sa FlexS ang reference-ligand ay ipinapalagay na maging matibay, kaya, dapat itong ibigay sa isang tulad kung saan ay katulad sa nakagapos estado. Ang superposisyon algorithm sa FlexS nangangailangan ng maliit lamang manu-manong pakikialam. Maaari mong isama ang kaalaman na ito sa computations sa FlexS sa pamamagitan ng pagsasakatuparan ng manu-manong solong hakbang. Kaya, FlexS ay dinisenyo para sa interactive na gawa sa mga pares ng ligand pati na rin para ligand-based virtual screening. Ang dalawang pangunahing mga aplikasyon ng FlexS ay ligand sobrang pagpoposisyon (hal. Para sa CoMFA / QSAR) at virtual screening. Kung mayroon kang isang protina at isang maliit na Molekyul na may-bisang dito (sa gayon tinatawag na reference-ligand) ngunit walang mga istraktura ng protina, maaari mong gawin ang reference istraktura bilang isang negatibong fingerprint ng mga aktibong site. FlexS tumutukoy sa pagkakapareho sa pagitan ng pagsubok at ang reference na kaayusan sa pamamagitan ng pagpapantay sa kanila. Sa virtual na screening, mayroon ka ng isang reference-ligand at isang hanay ng mga compounds at interesado ka sa prioritizing ang compounds para sa mga pang-eksperimentong pagsubok.