MultiGeneBlast

MultiGeneBlast ay isang open source tool na batay sa isang muling pag-format ng mga header FASTA ng NCBI GenBank entry protina, gamit na maaari itong subaybayan ang kanilang pinagmulan nucleotide at mga coordinate. MultiGeneBlast maaaring makatulong sa pag-detect ng nasabing multigene piyesa para sa mga proyektong gawa ng tao biology. Ang isang gawa ng tao na library ng operons ay maaaring malikha batay sa mismong output upang makilala ang mga operons na ang function ay pinakamalapit sa isa ninanais ng user. Ang tool na ito ay nagbibigay ng pagkakataon upang makilala ang lahat homologo genomic mga rehiyon sa pamamagitan ng pagsasama ng mga resulta ng solong BlastP ay tumatakbo sa bawat gene, at pagbubukod-bukod ng genomic mga rehiyon mula sa anumang mga entry GenBank sa bilang ng mga hit, synteny konserbasyon, at pinagsama-samang sabog bit ng kalidad. Arkitektura paghahanap maisasagawa upang mahanap ang anumang mga genomic mga rehiyon na may sabog hit sa anumang kumbinasyon na tinukoy ng user ng Amino Acid mga pagkakasunud-sunod.