Ghemical

Ghemical ay isang computational package kimika software na inilabas sa ilalim ng GNU GPL. Ito ay nangangahulugan na ang buong source code ng mga pakete ay magagamit, at mga user ay libre upang mag-aral at baguhin ang package. Ghemical ay nakasulat sa C ++.
Ghemical proyekto ay may isang graphical interface ng gumagamit (na kung saan ay batay sa Gnome), at ito ay sumusuporta sa parehong kabuuan-mekanika (semi-mula sa obserbasyon at AB initio) modelo at molekular mekanika modelo (doon ay isang experimental Tripos 5.2-like field puwersa para sa organic molecu Gayundin isang kasangkapan para sa pinababang modelo ng protina [1] ay kasama. Geometry optimization, molecular dynamics at ang isang malaking hanay ng mga tool visualization ay kasalukuyang magagamit.
Ghemical nakasalalay sa mga panlabas na code upang magbigay ng kabuuan-makina kalkulasyon. Semi-mula sa obserbasyon paraan MNDO, Mindo / 3, AM1 at PM3 dumating mula sa mga package MOPAC7 (Public Domain), at kasama sa mga distribution source.
Ang MPQC package (GNU GPL) ay ginagamit upang magbigay ng AB initio pamamaraan: ang pamamaraan batay sa Hartree-Fock theory ay kasalukuyang suportado sa batayan set hanggang mula sa STO-3G na 6-31G **.
Ang MPQC code ay hindi kasama sa pamamahagi source. Upang magamit-based MPQC AB initio pamamaraan sa Ghemical, kailangan mo munang sumulat ng libro at i-install ang program MPQC para sa iyong system, at pagkatapos ay sumulat ng libro Ghemical gamit ang ilang tiyak na mga setting na na-link sa mga programa sama-sama; makita ang INSTALL file para sa karagdagang impormasyon. Naglalaman din Ghemical ang OpenBabel pakete para sa import at export ng maraming iba't-ibang mga format ng file (pati na rin ang iba pang mga gawain).
Instalasyon
Kapag ikaw ay may-download ang pinakabagong release, dapat mong kunin ang lahat ng mga file mula sa iyong archive file gamit ang "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz" o equivalently "gunzip ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf ghemical-1.00.tar". Matapos na mangyaring basahin ang "INSTALL" -file nakuha mo lamang upang makakuha ng karagdagang impormasyon.
Ano ang Bago sa Paglabas na ito: