Staden Package

Screenshot Software:
Staden Package
Mga detalye ng Software:
Bersyon: 1.7.0 / 2.0.0 Beta 8
I-upload ang petsa: 12 May 15
Lisensya: Libre
Katanyagan: 155

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 1)

staden Package ay isang ganap na binuo set ng DNA sequence pagpupulong (Gap4), pag-edit at pagtatasa ng mga kasangkapan (iikot) para sa Unix, Linux, MacOSX at MS Windows.
Sa Gap4 front nagkaroon ng ilang mga menor de edad sa pagsali kaugnay
pagpapabuti sa kung paano ito scores nagdurugtong sa Maghanap Internal pagsali at ang
pag-andar ng button align sa Sumali Editor.
Gayundin ng resulta sa gap4 mga iba't-ibang mga pagbabago sa io_lib (ang
library para sa lahat ng I / O sa iba't-ibang mga format ng trace file). Sa pamamagitan ng karagdagan
ng isang bagong programa hash_exp ngayon ito ay nagbibigay-daan para sa mga file na eksperimento upang maging
concatenated sama at na-index. Ang listahan ng mga pangalan ng file na eksperimento
dapat stil ibinibigay sa gap4, ngunit ibinigay ang kapaligiran EXP_PATH
variable ay naitakda nang tama gap4 ay maaaring ikuha indibidwal
sequences labas ng concatenated file eksperimento
archive. Pagpapabuti sa user interface para sa mga ito kailangan pa rin upang maging
ginawa.
454 SFF archives ay mas mahusay na ngayon ang suportado. Ang defsult 454 indeks
ngayon sa trabaho, kahit na maaaring gamitin sa programa hash_sff upang magbigay ng isang
alternatibo diskarte sa pag-index (marahil ay mas mabilis na sa ilang mga kaso).
Gap4 at trev magkaroon din ng iba pang mga bakas style display para sa bakas na
may 1 sample scan (x4 channels) per base call. Sa kasong ito maaari ito
maglabas din 4 values ​​pagtitiwala sa halip ng 1 per base. Ang mga kakayahan
ay magpapahintulot sa mas mahusay na integration ng Solexa bakas kapag mas magaan
magagamit.
Plus of course sa karaniwang halo ng mga pag-aayos ng bug at mga menor de edad tweaks. Tingnan ang
full baguhin log para sa mga detalye (sa pamamagitan ng site SourceForge).
Iba pang mga tanyag na pagbabago
Gap4

Katulad na software

Orthanc
Orthanc

18 Jul 15

LSim
LSim

2 Jun 15

VULCAN
VULCAN

20 Feb 15

Mga komento sa Staden Package

Mga Komento hindi natagpuan
Magdagdag ng komento
I-sa mga imahe!