CLC Sequence Viewer ay lumilikha ng isang software na kapaligiran pagpapagana ng mga gumagamit upang makagawa ng isang malaking bilang ng mga bioinformatics pinag-aaralan, na sinamahan ng mahusay na pamamahala ng data, at mahusay na graphical na pagtingin at output mga pagpipilian.
Ano ang bago sa ito release:
Mga bagong tampok at mga pagpapabuti
-
ang lahat ng NCBI server komunikasyon ay ngayon naka-encrypt. (NCBI ay gumagalaw ang lahat ng mga serbisyo sa web sa HTTPS protocol sa Septiyembre 30, 2016) & nbsp;.
-
Ang listahan ng mga enzymes pre-install sa workbench & nbsp; Na-update mula sa rebase.
-
ang Quick tool Launch ay matatagpuan ngayon sa ilalim ng Toolbox menu sa halip na sa menu ng View at isang pindutan na tinatawag Launch na pinagsasama-up ang tool na ito ay naidagdag na sa ang toolbar.
- Ang pagpipilian na "ay hindi sa listahan ng" ay ipinakilala bilang isang bagong opsyon talahanayan filtering.
-
Ang "Ayusin folder na" tool ngayon ay gumagamit ng mga de-numerong pag-uuri para sa filenames may prefix na isang numero.
- New placeholder ay magagamit kapag pagtukoy sa mga pangalan ng tagaluwas outputs: & nbsp; {User}, & nbsp; {host}, at para sa mga elemento ng timestamp ng output object, {taon}, & nbsp; {buwan}, & nbsp; {day}, & nbsp; {hour, & nbsp; {minute}, & nbsp; . {ikalawang} & nbsp;
- placeholder loob pangalan export output na dati magagamit lamang bilang digits maaari na ngayong tinukoy gamit nakasulat na mga pangalan: {input} ay isang salitang kasingkahulugan para sa {1}, {extension} ay isang salitang kasingkahulugan para sa {2} at {counter} ay isang salitang kasingkahulugan para sa {3}.
-
GenBank import ngayon ay nagpapahintulot din para sa mga pangalan ng file na may 'GBFF' extension.
-
Magbasa ng mga detalye ng grupo ay ipinapakita na ngayon sa Element Info view ng listahan sequence.
-
Fixed isang bihirang isyu kung saan ang ilang mga annotation ng dati , ngunit ay hindi kinakailangan, pumunta nawawala sa & nbsp; sequences na may mas higit sa 1000 mga anotasyon ng isang naibigay na uri sa sequence na bago ang pagtanggal at kung saan ang right-click context menu option "Tanggalin pagpili" ay ginamit & nbsp;.
-
Ang Nakatakdang ng isang bug sa "Pamahalaan ang Enzymes" wizard na pumigil ang isang gumagamit mula sa pagkansela ng pagkilos kung "I-save bilang bagong enzyme list" ay pinagana.
-
Fixed isang isyu na may Import Metadata tool kung saan, kung ang isang spreadsheet ay nai-load, pagkatapos ay pagpili muli ang parehong spreadsheet ay hindi i-reload ang spreadsheet nilalaman.
-
Fixed isang isyu kung saan ito kinuha ng isang mahabang oras upang buksan ang isang workbench ito ito ay & nbsp; previouslyclosed kapag nagpapakita ng isang bukas na mesa editor na ay pinagsunod-sunod & nbsp;.
-
Fixed isang isyu kung saan pag-right click sa isang graph sa isang ulat at pagpili upang ipakita ang "Report", "Kasaysayan" o "Element Info" nag-trigger ng isang error.
- Iba't ibang mga menor bugfixes .
Ano ang bago sa bersyon 7.7:
- Ang lahat ng Excel sheet sa isang dokumento ay ngayon na-import at ang bawat sheet ay may isang table na nilikha para sa mga nilalaman nito.
- Ang CSV, HTML at Excel table / hugis ng mga talaan tagaluwas ngayon gamitin ang "Inf "at" NaN "halaga upang palitan ang hindi maliwanag"? ".
- sa wizard para sa export ng lamesa sa CSV format, kapag hindi pag-export ang lahat ng mga haligi, ito ay posible na ngayon upang kanselahin o bumalik sa nakaraan step habang napiling haligi ay naglo-load & nbsp;.
- Same setting print ay maaari na ngayong-apply para sa maramihang mga ulat sa isang solong pag-export & nbsp;.
- Ang "Pamahalaan ang Mga Mapagkukunan" na tab ay inalis mula . ang mga Plugin Manager
Ano ang bago sa bersyon 7.6.1:
Pag-aayos ng Bug
- Inayos ang isang isyu kung saan ang ilang filtering operasyon, tulad ng "ay hindi naglalaman ng" ay hindi kumilos nang tama kapag pagsala cell talahanayan na naglalaman ng maramihang mga piraso ng impormasyon.
- Fixed isang isyu kung saan annotation na spanned sa mga wakas ng isang pabilog na sequence ay hindi tama ang inilagay sa Circular sequence View.
- ang Nakatakdang ng isang bug na sanhi ng workbench upang i-freeze kung ilang mga sequences ay ipinapakita sa circular view na may hugis ng bituin pag-render ng label.
- Inayos ang isang isyu kung saan ang ilang filtering operasyon, tulad ng "ay hindi naglalaman ng" ay hindi kumilos nang tama kapag pagsala cell talahanayan na naglalaman ng maramihang mga piraso ng impormasyon.
- Inayos ang isang isyu na pumigil sa isang root folder sa Windows mamaneho mula sa ginagamit bilang file Location.
- mga Fixed isang isyu kung saan pag-update ng isang umiiral na instalasyon sa Windows ay magreresulta sa .vmoptions file tinatanggal, na gumagawa ng Workbench run sa . default Java configuration
Ano ang bago sa bersyon 7.6:
Mga bagong tampok at mga pagpapabuti
- Ang isang 3D Molecule Viewer ay magagamit na ngayon para sa visualization ng protina, RNA, DNA, at maliit na molecules.
- Pinahusay na pag-uulat ng mga error na may kaugnayan sa mababang puwang sa disk.
- Fixed problema sa mga link at teksto sa mga talahanayan na ay ina-cut off kapag succeeding isang link
- Restriction site analysis:. Ang mga halaga "cut posisyon (s) "haligi ng paghihigpit site na pagtatasa talahanayan ngayon behaves tulad ng mga numero sa halip ng teksto, ibig sabihin pag-uuri at pag-filter gawa.
-
ang isang problema sa naka-save na setting ng talahanayan na kung minsan ay hindi gumagana ay naayos na. Ang bug fix ay nagsasama ng isang mas matatag na / generic na paraan ng pag-save ng mga setting talahanayan na may iba't ibang mga hanay. Upang ayusin ang problemang ito, ang mga umiiral save na setting talahanayan ay dapat munang ma-load sa isang bagay kung saan ito gumagana (ibig sabihin, ay may parehong mga haligi bilang kapag ito ay nai-save); at pagkatapos ay ang mga setting ng talahanayan ay dapat na naka-save sa ang lumang pangalan patungan ang mga setting & nbsp;
-
Metadata para phylogenetic puno:. Ang isang bug ay naayos na & nbsp; sa pag-import ng metadata na naglalaman column mga pangalan na may colons.
- Fixed error kapag nagpapakita protina pagsasalin ng annotation mas maikli than 3 bases.
Ano ang bago sa bersyon 7.5:.
- Ang hindi nagamit na "Workflows" button ay inalis mula sa toolbar
- Lokal na Paghahanap pinagana mula sa menu bar Kasama na ngayon sa pag-filter sa "Path".
- Advanced filter sa talahanayan Kasama na ngayon sa pamamagitan ng opsyon upang i-filter para sa isang puwang, kuwit o semi-colon delimited listahan ng mga termino.
- Mag-zoom kasangkapan redesign:. Ang Mag-zoom sa tampok pagpili ay ngayon din magagamit para sa pagkakasunud-sunod, mga listahan sequence, alignments, at basahin mappings
- Pag-save / paglalapat setting side-panel para sa mga talahanayan ay gumagana na ngayon para sa iba't ibang mga talahanayan na ibahagi ang ilang mga haligi & nbsp;..
-
Kopyahin operasyon ay maaari na ngayong tumigil
-
I-import ng Halimbawa Data at mga pag-import gawin sa pamamagitan ng pag-drag ang mga file sa workbench at pag-drop ang mga ito sa Navigation Area ay hindi na i-block ang user interface habang Isinasagawa. Sa halip, ang pag-import ang mangyayari bilang isang proseso ng background na maaaring sinusubaybayan at kinokontrol sa pamamagitan ng tab na Mga Proseso sa ibabang kaliwang sulok.
- CLC workbenches ngayon suportahan ang mataas na resolution ng display tulad ng Apple retina display ng lahat ng data na ipinapakita sa View Area (kabilang ang mga tooltip).
- Higit nagbibigay-kaalaman pagpapangalan ng coding pagsasalin rehiyon ginawa sa pamamagitan ng tool Isalin sa protina. Ang pangalan para sa isang coding rehiyon translation ay binubuo ng mga pangalan ng input sequence na sinusundan ng ang uri ng anotasyon at panghuli ang annotation pangalan.
Mga Komento hindi natagpuan