codonPhyML

codonPhyML gumagamit ng Markovian codon mga modelo ng paglaki sa phylogeny-tatag. Given isang hanay ng mga species nailalarawan sa pamamagitan ng kanilang DNA sequence bilang input, ay magbabalik codonPhyML ang Punong pilohenetiko na pinakamahusay na naglalarawan sa kanilang relasyon sa gitna ng ebolusyon. Mayroon itong NNI at SPR puno Topology hyuristiko paghahanap, mga parameter ng pagpapalit na rate tinatantya ng maximum na posibilidad, at suporta sa pamamagitan ng multicore OpenMP.