BioRuby

BioRuby nagbibigay ng isang pinagsama-samang kapaligiran para Bioinformatics (Biology Impormasyon science).
Object oriented na scripting wika Ruby ay maraming mga tampok na angkop para sa bioinformatics pananaliksik, halimbawa, malinaw na syntax na ipahayag ang kumplikadong mga bagay, regular na expression para sa paghawak ng teksto bilang malakas na bilang Perl & rsquo; s, iba't ibang uri ng mga aklatan kabilang ang mga serbisyo sa web at iba pa
Bilang ng Ruby syntax ay simple at napakalinis, naniniwala kami na ito ay madaling upang matuto para sa mga nagsisimula, madaling gamitin para sa mga biologist, at din malakas na sapat para sa mga software developers.
Sa BioRuby, maaaring makuha ang mga developer biological entries database mula flat file, internet server ng web at mga lokal na pamanggit database.
Ang mga entry na database maaaring mai-parse sa pagkuha ng impormasyon na kailangan mo. Biyolohikal mga pagkakasunud-sunod ay maaaring magamot sa pagtupad pamamaraan ng Ruby & rsquo; String class s at sa mga regular na expression.
Maaaring nakapaloob library Ang may mga kasangkapan tulad sabog, Fasta, Hmmer at marami pang ibang mga pakete ng software para sa biological analysis.
 Sinusuportahan BioRuby malalaking mga format ng biological database at nagbibigay ng maraming mga paraan para ma-access ito sa pamamagitan ng flatfile pag-index, SQL, mga serbisyo sa web atbp iba't ibang mga serbisyo sa web kabilang Kegg API ay maaaring madaling ginagamit ng BioRuby.

Mga Tampok :

• BioRuby shell
• API
• Documentation

Mga kinakailangan

• Ruby 1.8.7 o mas mataas