Topographica

Topographica ay isang software package para sa computational pagmomodelo ng neural mga mapa.
Ang object ay upang makatulong sa mga siyentipiko na maunawaan utak function sa antas ng topographic mapa na bumubuo ng pandama at motor na mga sistema.
Topographica ay inilaan upang makadagdag sa mga maraming mga mahusay na simulators mababang antas na neuron na magagamit, tulad ng simula at Neuron. Ang mga simulators focus sa modeling ang detalyadong panloob na pag-uugali ng mga neuron at maliit na mga network ng mga ito.
Topographica halip ay tumutuon sa mga malakihang istraktura at mga function na ito ay makikita lamang kapag ang maraming mga libo ng mga naturang mga neuron ay konektado sa topographic mapa na naglalaman ng milyon-milyong mga koneksyon.
Maraming mahalagang pangyayari ay hindi maaaring ma-aral nang hindi tulad ng mga malalaking network, kabilang ang dalawang-dimensional na organisasyon ng visual orientation at mapa direksyon ng paggalaw, at object segmentation at pagsasama-proseso.
Upang gumawa ng tulad ng mga modelo praktikal, sa Topographica ang pangunahing yunit ay isang sheet ng neurons, sa halip na isang neuron o isang bahagi ng isang neuron.
Para sa karamihan ng mga simulation, ang mga sheet ay maaring ipatupad sa isang mataas na antas, na binubuo ng mga abstract pagpapaputok-rate o neurons maisama-and-sunog.
Kapag kinakailangan para sa pagpapatunay o para sa partikular na pangyayari, Topographica ay madaling patagalin ang paggamit ng isang Sheet na interface upang mas detalyadong neuron na modelo sa iba pang mga simulators.
Mas-detalyadong mga sheet ay maaaring ring pansamantalang gamitin, hal kapag nakikipag-ugnayan sa mga modelo sa real time.
Sa buong, Topographica ginagawang mas simple na gumamit ng isang naaangkop na antas ng detalye at pagiging kumplikado, gaya ng ipinasiya ng mga magagamit na kapangyarihan computing, phenomena ng interes, at halaga ng biological na data na magagamit para sa pagpapatunay.
Ang figure sa itaas sa kanan ay nagpapakita ng isang halimbawa ng modelo ng maagang yugto sa visual na sistema Topographica, pagmomodelo paano retinal na input ay nabago sa pamamagitan ng thalamus, pangunahing visual cortex, at mas mataas na cortical lugar. Dahil Topographica ay isang pangkalahatang-layunin mapa simulator, ito rin ay sumusuporta sa anumang iba pang madaling makaramdam modaliti na isinaayos sa topographic mapa, tulad ng touch at pandinig, pati na rin ang mga lugar na motor.
Topographica ay malayang magagamit para sa pag-download, at ay isang open source na proyekto na ang mga kakayahan ay maaaring pinalawak at binago ng anumang mga gumagamit. Tinatanggap namin ang mga kontribusyon mula sa mga gumagamit, at mag-imbita ng mga tao na interesado na sumali sa aming globally ipinamamahagi development team.
Kahit na ang code ay pa rin sa ilalim ng napaka-aktibo sa pag-unlad, ito ay sa araw-araw na gamitin sa iba't-ibang mga proyekto sa pananaliksik at akademikong mga klase.
Dahil sa mabilis na tulin ng kasalukuyang pag-unlad, ang pagiging isang developer ay marahil ang pinakamahusay na paraan upang panatilihin up sa lahat ng mga pagbabago.