proTRAC

proTRAC ay isang natatanging at madaling gamitin na tool para sa probabilistic piRNA kumpol pagkakita, visualization, at pag-aaral. proTRAC ay nagpapakita ng mas mataas na sensitivity at selectivity kumpara sa hanggang ngayon inilapat mga pamamaraan ng detection kumpol. Ang kabuluhan ng mga na-obserbahan pagkakasunud-sunod magbasa pindutin ang density, mapasadsad bias, halaga ng loci naaayon sa madalang na nai-map pagkakasunud-sunod bumabasa, halaga ng loci sa T sa posisyon 1 o A sa posisyon 10 at ang halaga ng loci loob ng hanay ng mga tipikal na haba piRNA (26- 32nt) ay isinasaalang-alang. Ang sinusunod na mga katangian ng mga kandidato kumpol ay nasuri sa liwanag ng ibinigay dataset at nakabatay sa isang probabilistic sistema ng pagmamarka.