Swiss-PdbViewer (aka DeepView) ay isang application na nagbibigay ng isang user friendly na interface na nagbibigay-daan upang pag-aralan ang ilang mga protina sa parehong oras. Ang mga protina ay maaaring superimposed upang mahinula structural alignments at ihambing ang kanilang aktibong mga site o anumang iba pang mga may-katuturang bahagi. Asidong amino mutations, H-bono, mga anggulo at distansya sa pagitan ng atoms ay madaling makuha salamat sa intuitive graphic at menu interface.
Swiss-PdbViewer (aka DeepView) ay developped dahil 1994 sa pamamagitan ng Nicolas Guex. Swiss-PdbViewer ay mahigpit na naka-link sa Swiss-MODEL, isang awtomatikong homology pagmomodelo server na binuo sa loob ng Swiss Institute of Biyoimpormatika (SIB) sa istruktura Biyoimpormatika Group sa Biozentrum sa Basel.
Paggawa gamit ang dalawang programa lubos na binabawasan ang dami ng trabaho na kailangan upang bumuo ng mga modelo, dahil posibleng sa thread ng protina pangunahing sequence sa isang 3D template at makakuha ng isang agarang feedback ng kung gaano kahusay ang may sinulid protina ay magiging tinanggap ng sanggunian istraktura bago magsumite ng isang kahilingan upang bumuo ng mga nawawalang mga loop at pinuhin ang sidechain pagpapakete.
Swiss-PdbViewer maaari ring basahin elektron density ng mga mapa, at nagbibigay ng iba't ibang mga tool upang bumuo sa density. Bilang karagdagan, ang iba't ibang mga tool sa pagmo-modelo ay pinagsama-sama at command na file para sa sikat na enerhiya minimization mga pakete ay maaaring likhain.
Sa wakas, bilang isang espesyal na bonus, POV-Ray eksena ay maaaring nabuo mula sa kasalukuyang view upang gawin ang mga nakamamanghang larawan kalidad ray-traced.
Ano ang bagong sa paglabas:
- Ang Thymine C6 atom ay ngayon tama ang na-load
- Fixed ang POV-Ray output walang katapusang loop sa PC version
- Ang paminsan-minsang pag-crash habang sine-save PDB file (tulad ng 2i37) sa PC Naayos na ang
- -update ang address ng Uppsala Electron Density Map Server
Mga Komento hindi natagpuan