MACS2 ay isang tool sa pagtatasa ng modelo batay sa chip-Seq data.
Sa pamamagitan ng pagpapabuti ng mga diskarte sa sequencing, chromatin immunoprecipitation sinusundan ng mataas na throughput sequencing (chip-Seq) ay nakakakuha ng popular na pag-aralan pakikipag-ugnayan Genome-wide protina-DNA. Upang matugunan ang kakulangan ng malakas na paraan ng pag-aaral chip-Seq, ipinapakita namin ang isang nobelang algorithm, na pinangalanang-based na Modelo Pagsusuri ng maliit na tilad-Seq (Mac), para sa pagtukoy ng transcript salik na nagbubuklod na mga site. Kumukuha ang mga Mac ang impluwensiya ng Genome pagiging kumplikado upang pag-aralan ang kahalagahan ng enriched rehiyon chip, at mga Mac ay nagpapabuti ng spatial resolution ng may-bisang mga site sa pamamagitan ng pagsasama-sama ng impormasyon ng parehong posisyon tag sequencing at kasarian. . Mac ay madaling gamitin para sa chip-Seq data nag-iisa, o gamit ang control sample sa pagtaas ng pagtitiyak
Mga Kinakailangan :
- Python
Mga Komento hindi natagpuan