HAKBANG ay isang pakete para sa mga eksaktong stochastic simulation ng reaksyon-pagsasabog sistema nagkataon kumplikadong geometries 3D. Ang aming mga pangunahing simulation algorithm ay isang pagpapatupad ng Gillespie ng SSA, pinahaba upang harapin ang...
tapir ay isang Python tool na naglalaman ng mga programa upang tantiyahin at balangkas phylogenetic informativeness para sa mga malalaking dataset. Binabanggit tapir Kapag gumagamit ng mga tapir, mangyaring tukuyin:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME:...
picme ay isang Python pakete na naglalaman ng mga programa upang tantiyahin at balangkas phylogenetic informativeness para sa mga malalaking dataset. Pag-install Para sa mga sandali, ang pinakamadaling paraan upang i-install ang mga programa ay:git clone...
tigreBrowser ay isang gene expression model na browser para sa mga resulta mula sa tigre R package (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Pag-install: nangangailangan tigreBrowser Python version> = 2.5. tigreBrowser maaaring...
checkmyclones ay isang software na nagbibigay ng mga kasangkapan upang suriin Sanger resulta sequencing. & Nbsp; (o anumang plain-text o FASTQ files) laban sa isang set ng mga reference sequences, na ibinigay sa anumang mga makatwirang format (kabilang...
Syntainia ay isang makabagong application para sa paggunita ng maramihang mga genomes. & Nbsp; Ito ay nagtatanghal ng isang simple at intuitive interface ng gumagamit upang tingnan at manipulahin ang relasyon sa pagitan ng mga grupo ng mga genes. Sa...
CWC Simulator ay isang C ++ pagpapatupad ng CWC, isang calculus para sa representasyon at simulation ng biological system. & Nbsp; Matapos ang isang matagumpay na-install (tingnan INSTALL) Makikita mo na patakbuhin ang simulation over CWC modelo, tulad ng...
AREM ay isang batay sa MACS (Based Pagtatasa Modelo para sa chip-Seq data).High-throughput sequencing kaisa sa chromatin immuno- ulan (chip-Seq) ay malawak na ginagamit sa characterising genome-wide na umiiral na pattern ng pagkasalin kadahilanan,...
AHREA ay isang Software suite na gumagawa ng paghahanap ng Kamag-anak Expression Learners madali. . Ito ay nakasulat sa Python Kinakailangan : ...
E-Cell System ay isang konsepto ng paggawa sa virtual na mga cell sa mga computer.E-Cell System ay isang object-oriented software suite para sa modeling, simulation, at pagtatasa ng mga malalaking antas kumplikadong system tulad ng biological cells,...
