Miso (pinaghalong mga Isoforms) ay isang probabilistic framework nakasulat sa Python na quantitates antas & nbsp ang pagpapahayag; ng Bilang kahalili, Spliced gene mula sa RNA-Seq data, at kinikilala differentially regulated isoforms o exons sa buong sampol.
Sa pamamagitan ng pagmomodelo ang nakakalikha proseso kung saan bumabasa ay ginawa mula sa isoforms sa RNA-Seq, ginagamit ang modelo Miso Bayesian hinuha upang makalkula ang posibilidad na ang isang nabasa na nagmula mula sa isang partikular isoform.
Miso ay gumagamit ng natukoy na pagtatalaga ng mga bumabasa sa isoforms sa quantitate ang abundances ng ang kalakip na hanay ng mga alternatibong isoforms mRNA. Agwat ng kumpyansa sa paglipas ng mga pagtatantya ay maaaring makuha, na tumyak ng dami ang pagiging maaasahan ng mga pagtatantya.
Mangyaring tingnan ang http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ para sa Miso manu-manong at dokumentasyon
Mga Kinakailangan :.
- Python
Mga Komento hindi natagpuan