Pinakamagaling Biyoimpormatika Para sa Linux
Genepidgin ay isang suite ng mga tool Python na tumulong sa pagsusuri at pagtatalaga gene mga pangalan ng produkto & nbsp; May tatlong pangunahing mga bahagi.:genepidgin * mas malinis *& Nbsp; standardizes mga pangalan ng gene sa bawat alituntunin sa...
HAKBANG ay isang pakete para sa mga eksaktong stochastic simulation ng reaksyon-pagsasabog sistema nagkataon kumplikadong geometries 3D. Ang aming mga pangunahing simulation algorithm ay isang pagpapatupad ng Gillespie ng SSA, pinahaba upang harapin ang...
TRMiner ay isang Python utility na naglalayong sa pang-agham curators data. & Nbsp; Pinapayagan nito upang mabilis na putulan malaking koleksyon ng mga pang-agham publication na pangungusap may kaugnayan para sa isang naibigay na pagmimina ng layunin.Ito...
Ang Bioinformatics Benchmark System ay isang pagtatangka upang bumuo ng isang makatwirang balangkas na pagsusuri, mga pagsusulit, at ang data, upang paganahin ang mga end user at vendor na suriing mabuti ang pagganap ng kanilang mga sistema.Ano namin...
staden Package ay isang ganap na binuo set ng DNA sequence pagpupulong (Gap4), pag-edit at pagtatasa ng mga kasangkapan (iikot) para sa Unix, Linux, MacOSX at MS Windows.Sa Gap4 front nagkaroon ng ilang mga menor de edad sa pagsali kaugnaypagpapabuti sa...
AREM ay isang batay sa MACS (Based Pagtatasa Modelo para sa chip-Seq data).High-throughput sequencing kaisa sa chromatin immuno- ulan (chip-Seq) ay malawak na ginagamit sa characterising genome-wide na umiiral na pattern ng pagkasalin kadahilanan,...
seriesoftubes ay isang pinalawig na pipeline para sa Solexa chip-seq data.Documentation Package
Mga Kinakailangan :
...
MetagenomeDB ay isang Python library na dinisenyo upang madaling tindahan, kunin at annotate metagenomic sequences. & Nbsp; MetagenomeDB kumilos bilang isang abstraction layer sa tuktok ng isang MongoDB database. Ito ay nagbibigay ng isang API upang...
Seal ay isang Python module na nagbibigay-align ng pagkakasunud-sunod sa Hadoop.Seal ay isang application ng MapReduce para sa biological pagkakahanay pagkakasunud-sunod. Ito ay tumatakbo sa Hadoop (http://hadoop.apache.org) sa pamamagitan ng Pydoop...
Miso (pinaghalong mga Isoforms) ay isang probabilistic framework nakasulat sa Python na quantitates antas & nbsp ang pagpapahayag; ng Bilang kahalili, Spliced gene mula sa RNA-Seq data, at kinikilala differentially regulated isoforms o exons sa buong...