MetagenomeDB ay isang Python library na dinisenyo upang madaling tindahan, kunin at annotate metagenomic sequences. & Nbsp; MetagenomeDB kumilos bilang isang abstraction layer sa tuktok ng isang MongoDB database. Ito ay nagbibigay ng isang API upang...
SSuMMo ay isang library ng mga pag-andar na dinisenyo sa paligid iteratively gamit hmmer upang italaga ang mga pagkakasunud-sunod na taxa. & Nbsp; Ang mga resulta ay lubos na nalagyan ng annotation puno na nagpapakita ng mga species / pamamahagi genus...
tigreBrowser ay isang gene expression model na browser para sa mga resulta mula sa tigre R package (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Pag-install: nangangailangan tigreBrowser Python version> = 2.5. tigreBrowser maaaring...
MACS2 ay isang tool sa pagtatasa ng modelo batay sa chip-Seq data.Sa pamamagitan ng pagpapabuti ng mga diskarte sa sequencing, chromatin immunoprecipitation sinusundan ng mataas na throughput sequencing (chip-Seq) ay nakakakuha ng popular na pag-aralan...
edittag ay isang koleksyon ng application para sa pagdidisenyo ng mga hanay ng mga pag-edit sukatan pagkakasunud-sunod ng mga tag, pagsusuri sa pagkakasunud-sunod ng mga tag para tulad sa panukat na i-edit, at pagsasama ng pagkakasunud-sunod ng mga tag sa...
MacMolPlt ay isang programa modernong graphics para sa pangbalangkas 3-D na molekular istruktura at normal mode (vibrations). Modern...
picme ay isang Python pakete na naglalaman ng mga programa upang tantiyahin at balangkas phylogenetic informativeness para sa mga malalaking dataset. Pag-install Para sa mga sandali, ang pinakamadaling paraan upang i-install ang mga programa ay:git clone...
SyntenyMiner ay isang application upang mailarawan at tanungin paghahambing sa pagitan ng maramihang mga kumpletong genome sequence. Ang interface ay nagbibigay ng isang navigable view ng mga tugma sa isang pagkakasunod-sunod reference genome. Sequence...
ProteinShop ay isang interactive na tool para sa pagmamanipula ng mga istraktura na protina. Ito ay dinisenyo upang mabilis na lumikha ng isang set ng kumpigurasyon protina paggamit ng kaalaman ng tao at intuwisyon. Ang mga pagsasaayos ay maaaring...
PySCeS ay isang proyekto na binuo ng Triple-J Group para sa Molecular Cell Physiology. & Nbsp; upang subukan modelo at maunawaan ang mga komplikadong proseso at mga sistema na bumubuo sa living cell Mga Tampok :. Ang wika ng paglalarawan ng modelo...
